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高通量單細(xì)胞3'轉(zhuǎn)錄組試劑盒
2022年AACR年度會議中,Michelle Monje等人關(guān)于CAR-T治療H3K27M突變的彌漫性橋腦膠質(zhì)瘤(Diffuse intrinsic pontine glioma,DIPG)和彌漫性中線膠質(zhì)瘤(Diffuse midline gliomas,DMG)的研究獲得了廣泛的關(guān)注,而單細(xì)胞測序技術(shù)也在此項(xiàng)研究中發(fā)揮了重要作用。該論文于2022年2月7日在線發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《自然》。
CAR-T細(xì)胞治療技術(shù)是目前廣受關(guān)注的癌癥前沿療法,其原理為:人為給正常T細(xì)胞加入特定癌細(xì)胞表面抗原的受體,使T細(xì)胞能特異的和癌細(xì)胞結(jié)合,從而通過細(xì)胞殺傷作用來殺傷癌細(xì)胞。
CAR-T細(xì)胞治療技術(shù)一經(jīng)問世,首先在血液系統(tǒng)惡性腫瘤的治療中發(fā)揮了極大的優(yōu)勢,截至到2022年3月末,已有6款CAR-T 產(chǎn)品中獲 FDA 批準(zhǔn)上市,NMPA也已批準(zhǔn)2款CAR-T產(chǎn)品上市。目前針對實(shí)體瘤的CAR-T治療也在快速開發(fā)中。
圖片來源于網(wǎng)絡(luò)
H3K27M型DIPG/DMG是一種極具侵襲性的單發(fā)致命腫瘤,幾乎沒有治療選擇,平均預(yù)期壽命為診斷后10個(gè)月,5年生存率不到1%。
Michelle Monje團(tuán)隊(duì)在此前的研究中發(fā)現(xiàn),雙唾液神經(jīng)節(jié)苷脂 (Disialogangliosid,GD2)在H3K27M突變的彌漫性中線膠質(zhì)瘤細(xì)胞上高度表達(dá),因此他們選定GD2作為DIPG/DMG潛在的CAR-T細(xì)胞治療靶點(diǎn),并在小鼠中進(jìn)行了初步的探索。
在本研究中,研究人員先通過靜脈注射1×10^6 Cells/Kg劑量GD2-CAR T 細(xì)胞的形式對多位DIPG/DMG患者進(jìn)行了篩選,最終選定4名H3K27M突變型DIPG/DMG患者接受GD2-CAR T輸注(3名DIPG患者,1名脊髓DMG患者 ),在腦室內(nèi)給藥。
a.MRI結(jié)果顯示DIPG 3號患者腫瘤明顯減小
b.DIPG 3號患者表現(xiàn)出明顯的生理緩解
臨床結(jié)果顯示,4名患者中有3名在靜脈注射GD2-CAR T細(xì)胞后獲得了影像學(xué)和臨床獲益(一名脊髓DMG患者在CAR T細(xì)胞制備過程中出現(xiàn)了快速的腫瘤進(jìn)展,因而從研究中移除),患者診斷后壽命明顯延長,且患者在神經(jīng)功能方面出現(xiàn)了明顯的恢復(fù)現(xiàn)象。但是,GD2-CAR T細(xì)胞進(jìn)入人體后經(jīng)過了怎樣的歷程?GD2-CAR T細(xì)胞又與癌細(xì)胞、免疫細(xì)胞發(fā)生了怎樣的相互作用? 這些還需要更精細(xì)的研究方法來解答。
為了更加深入地理解GD2-CAR T細(xì)胞輸注后的起效機(jī)制,研究人員利用單細(xì)胞測序技術(shù)進(jìn)行了進(jìn)一步的分析研究。研究者取了4位患者不同治療階段的腦脊液(cerebrospinal fluid,CSF)樣本,以及CAR T細(xì)胞制品中分離得到的CAR陽性、陰性T細(xì)胞,進(jìn)行了單細(xì)胞RNA測序分析。實(shí)驗(yàn)完成25598個(gè)來自CSF,40000個(gè)來自CAR T細(xì)胞制品,共65598個(gè)細(xì)胞的RNA測序。
基于單細(xì)胞RNA測序分析后得到的CSF樣本細(xì)胞圖譜
基于RNA測序數(shù)據(jù)的CSF樣本細(xì)胞圖譜結(jié)果顯示,CSF樣本中除了淋巴細(xì)胞、髓樣細(xì)胞、罕見星形膠質(zhì)細(xì)胞和B細(xì)胞,還有一群雙重譜系細(xì)胞(右上圖,紅色框框出),暗示患者體內(nèi)可能存在髓樣細(xì)胞吞噬T細(xì)胞的可能性。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析不同的骨髓細(xì)胞亞群
研究者針對給藥后的CSF樣本中髓系細(xì)胞,進(jìn)一步進(jìn)行了更細(xì)致的細(xì)胞圖譜分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),髓系細(xì)胞可分為7種不同的細(xì)胞群,包括表達(dá)各種功能特征的單核細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞和巨噬細(xì)胞,以及增殖的骨髓細(xì)胞。
不同治療時(shí)間段CSF樣本中髓系細(xì)胞比例
分析結(jié)果顯示,在腦內(nèi)室給藥后的炎癥峰值時(shí)間點(diǎn)上,出現(xiàn)了以干擾素應(yīng)答為特征的髓系細(xì)胞,該細(xì)胞群顯示出明顯的免疫激活特征。相比之下,靜脈注射和給藥點(diǎn)晚期,腦脊液髓樣細(xì)胞亞群表達(dá)了顯著的吞噬作用和脂質(zhì)代謝基因程序,這些細(xì)胞表現(xiàn)出強(qiáng)烈的免疫抑制特征。以上這些結(jié)果都為GD2-CAR T細(xì)胞治療 H3K27M+ 突變型DIPG/DMG 的有效性提供了進(jìn)一步的證據(jù)。
綜上, 單細(xì)胞測序技術(shù)進(jìn)一步從細(xì)胞層面和基因表達(dá)層面探究了GD2-CAR T 治療H3K27M+ DIPG/DMG的過程,觀察到了不同治療階段、不同給藥途徑、不同患者的異質(zhì)性,對于理解GD2-CAR T發(fā)揮作用的機(jī)理和后續(xù)臨床研究都有指導(dǎo)意義。
當(dāng)前利用CAR-T技術(shù)用于治療胃癌、胰腺癌,結(jié)直腸癌,黑色素瘤、肝癌的各項(xiàng)研究正在如火如荼中進(jìn)行。單細(xì)胞測序技術(shù)可用于探究輸注前后CAR-T細(xì)胞的增殖與克隆情況,輸注前后不同階段機(jī)體各細(xì)胞基因表達(dá)的變化,輸注前后機(jī)體各細(xì)胞類型與克隆、增殖和療效間的關(guān)系,體內(nèi)CAR-T細(xì)胞實(shí)際作用情況與機(jī)制等各細(xì)胞治療環(huán)節(jié)。相信未來,單細(xì)胞測序技術(shù)必將在CAR-T等細(xì)胞治療技術(shù)中發(fā)揮更多的作用。
1 Majzner, R. G. et al. GD2-CAR T cell therapy for H3K27M-mutated diffuse midline gliomas. Nature. 603, 934–941 (2022).2 Mount, C. W. et al. Potent antitumor efficacy of anti-GD2 CAR Tcells in H3-K27M+ diffuse midline gliomas. Nat. Med. 24, 572–579 (2018).3 Cooney, T. et al. Contemporary survival endpoints: an International Diffuse Intrinsic Pontine Glioma Registry study. Neuro-Oncol. 19, 1279–1280 (2017).