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單細(xì)胞測序技術(shù)用于心臟再生醫(yī)學(xué)

網(wǎng)站編輯:墨卓生物科技(浙江)有限公司 │ 發(fā)布時間:2023-06-25 

心臟是哺乳動物發(fā)育階段最先形成的器官,為全身生命活動提供血液支持。雖然心臟功能如此關(guān)鍵,但成熟的心肌細(xì)胞一般不具有增殖能力,導(dǎo)致心臟損傷不可逆轉(zhuǎn),因此全世界范圍內(nèi)很多科學(xué)家都在探索如何使心臟恢復(fù)再生能力[1][2]。

目前,在心臟再生能力的研究方面,大家最為關(guān)注的是:如何讓成熟的心肌細(xì)胞再次進行細(xì)胞增殖。因為心肌細(xì)胞可以自發(fā)跳動,所以,如果能有新增殖的心肌細(xì)胞代替受損的細(xì)胞,那么就很有可能實現(xiàn)心臟功能的修復(fù)。

為了尋找讓心肌細(xì)胞增殖的方法,近日,來自北京大學(xué)未來技術(shù)學(xué)院的熊敬維研究組在國際知名期刊《Cell Stem Cell》上在線發(fā)表了一項題為“A small-molecule cocktail promotes mammalian cardiomyocyte proliferation and heart regeneration”的單細(xì)胞測序研究。在這項研究里,作者發(fā)現(xiàn)了由幾個小分子組成的混合物,能使成體的心肌細(xì)胞實現(xiàn)增殖 ,進而促進心臟修復(fù)。

研究思路

通過體外-體內(nèi)-體外的流程來進行篩選和測試:

1. 首先通過體外的大規(guī)模篩選,找到備選的生物活性物質(zhì);

2. 再對這些具有生物活性的小分子進行動物體內(nèi)的實驗測試;

3. 最后將被激活的細(xì)胞在體外的環(huán)境下進行培養(yǎng)和單細(xì)胞測序分析。

文章主要研究內(nèi)容總結(jié)如下:

1. 藥物小分子組合可以刺激心肌細(xì)胞繁殖

為了找到讓心肌細(xì)胞增殖的方法,研究人員首先對成千上萬種藥物小分子進行了篩選,希望能從中找到刺激心肌細(xì)胞增殖的藥物。 為了篩選出好用的藥物,作者利用了兩種不同的系統(tǒng)來對藥物小分子進行篩選:

一種是FUCCI系統(tǒng),用來對備選藥物進行初篩,看藥物是否能讓心肌細(xì)胞“煥發(fā)青春”——“青春”了才有可能恢復(fù)增殖能力。

另一種是MADM系統(tǒng),用來對這些FUCCI系統(tǒng)篩選出來的備選藥物進行復(fù)篩,看哪些藥物能夠讓心肌細(xì)胞恢復(fù)“傳宗接代”的能力。

通過這兩個篩選系統(tǒng),作者篩選出了13種小分子,并經(jīng)過簡單的實驗證明,這些小分子是可以促進心肌細(xì)胞的增殖的。接下來,作者將這13個備選分子進行了隨機的兩兩組合,并且借助計算機的算法,最后確定了10組效果可能比較好的小分子的組合。

為了驗證這些組合的效果,作者又進一步對上面這10種組合做了FUCCI和MADM篩查。最后發(fā)現(xiàn),有5個小分子(合稱5SM)可以明顯地促進成體小鼠和大鼠心肌細(xì)胞的分裂和心臟再生。并且,一系列的病理學(xué)實驗也證明,5SM可以促進心肌梗死心臟的心肌細(xì)胞增殖。

2. 藥物小分子組合可以重新激活心臟功能

為了進一步研究5SM是如何促進心肌細(xì)胞增殖,作者首先進行了RNA-seq和ATAC-seq,發(fā)現(xiàn)5SM可以促使成熟的心肌細(xì)胞進行去分化,重新變?yōu)榉浅墒斓男募〖?xì)胞,真正“返老還童”,從而獲得再次分裂增殖的能力。
在這個過程中,有很多與糖酵解和去分化相關(guān)的基因被激活并活躍表達(dá),為心肌細(xì)胞的“返老還童”作出了貢獻。

3. 單細(xì)胞測序揭示心肌細(xì)胞增值通路

既然發(fā)現(xiàn)了和增殖及去分化相關(guān)的基因,那么新的問題又來了:這些基因是如何讓心肌細(xì)胞命運的發(fā)生改變,實現(xiàn)“返老還童”的呢? 為了回答這個問題,作者將大鼠心室的心肌細(xì)胞解離出來,在體外進行了培養(yǎng),并用5SM進行了處理,然后對處理后的心肌細(xì)胞進行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序。 通過對單細(xì)胞測序結(jié)果的分析,作者發(fā)現(xiàn)了一條心肌細(xì)胞命運轉(zhuǎn)變的通路:
在5SM處理后的心肌細(xì)胞中,除了一般心肌細(xì)胞會具有的CM1亞型,還有CM2和CM4這兩個在沒處理的心肌細(xì)胞里不會存在的亞型。而且,從發(fā)育分化的路徑來看,在5SM的刺激下,心肌細(xì)胞會沿著C1-C2-C4這條通路再次轉(zhuǎn)變到增殖期。

(注:左上圖說明通過單細(xì)胞測序分析發(fā)現(xiàn)了六個心肌細(xì)胞(CM)亞群,這些亞群彼此位置的近遠(yuǎn),代表不同亞群細(xì)胞基因表達(dá)相似性高低,越近越相似。圖中CM1、CM2、CM4處在相鄰的位置,說明它們的基因表達(dá)比較相似。右上圖說明CM1、CM2、CM4處在一條發(fā)育路徑上,是發(fā)生時間由早到晚的過程。)

這個過程可以認(rèn)為是心肌細(xì)胞的重新激活。成熟的心肌細(xì)胞在激活后會重新進入分裂循環(huán),為受損的心臟提供新的細(xì)胞來源,從而達(dá)到心臟修復(fù)的目的。

總結(jié)

這篇文章通過對小分子藥物的篩選,獲得了一組能夠促進心肌細(xì)胞增殖的藥物小分子組合,并通過單細(xì)胞測序研究了藥物的起效機制,證據(jù)鏈充分,應(yīng)用價值明顯。在單細(xì)胞測序技術(shù)的助力下,這項研究將處于瓶頸期的心臟再生醫(yī)學(xué)向前推進了一大步,為心梗相關(guān)疾病的治療帶來了福音。

參考文獻

[1] Fernández-Ruiz I. Rejuvenating cardiomyocytes facilitates heart regeneration. Nat Rev Cardiol. 2021, 18(12):807.
[2] Sadek H, Olson EN. Toward the Goal of Human Heart Regeneration. Cell Stem Cell. 2020, 26 (1):7-16.
[3] Garbern JC, Lee RT. Heart regeneration: 20 years of progress and renewed optimism. Dev Cell. 2022, 57(4):424-439.